Emirates reward flight cancelled. What actually happens to the points?

Good question, especially with everything going on around DXB.

If Emirates cancels the flight, you won’t need to use their refund form since it was booked with QFF points. Qantas controls the ticket. Normally when a partner reward gets cancelled, Qantas will either:

Rebook you on another Emirates flight if there’s availability in the same cabin

Offer an alternative routing if possible

Refund your points and taxes back to your account

You don’t just “lose” the seat, but you’re also not guaranteed another Business seat if there’s nothing available. Reward inventory is still reward inventory.

If it were me, I’d call Qantas Frequent Flyer rather than wait, especially if DXB is still shaky close to departure. Partner bookings can get messy last minute.